潟湖及河口紅樹林是蝦類重要棲息場所，許多蝦類在外海產卵，孵化後的幼生會移動到此生活，直到長成成蝦後，才回到較深的海中產卵。而有些棲息於沿岸海域的小型對蝦，包含多數赤對蝦屬種類，則不會進入河口及潟湖，而是分別在離岸及近岸海域之間移動，作為產卵場及孵育場，因此沿海海域為此類小型對蝦的重要繁殖場域。台江國家公園涵蓋七股潟湖、鹽水溪口、曾文溪口、近岸水深20公尺以淺海域及深度可達170公尺之黑水溝海域，地形多樣，為蝦類重要棲息海域，蘊藏豐富的蝦類資源。七股潟湖及其周邊水域為臺灣西南海域大型經濟蝦種的孵育場，七股潟湖內棲息著大量劍角新對蝦、長毛對蝦、草對蝦、短溝對蝦及近緣新對蝦的幼蝦。
長毛對蝦
Penaeus penicillatus
近緣新對蝦
Metapenaeus affinis
根據本處105-108年委託國立中山大學陳孟仙教授研究團隊調查結果及彙整文獻資料，台江國家公園蝦類計共14科84種。七股沿海優勢底棲蝦類為中華仿對蝦、長角仿對蝦、彎角鷹爪對蝦、婆羅門赤蝦及角突仿對蝦，更首次記錄到戴氏赤蝦、中型新對蝦、粗角管鞭蝦、脊額外鞭腕蝦、細指長臂蝦及小額南褐蝦。七股沿海的蝦類群聚組成正逐漸熱帶化，底層水溫的高低影響七股沿海過去10年來蝦類群聚組成的變動。
黑水溝航道優勢底棲蝦類為長角仿對蝦、戴氏赤蝦、彎角鷹爪對蝦、中華仿對蝦及鬚赤蝦。較特別的是106年在黑水溝採集到日本鈍龍蝦，鈍龍蝦屬在臺灣僅有3種的紀錄，因主要棲息於岩礁外圍及礁斜面地區，不易採集，因此標本數量稀少，過去的紀錄集中在東部海域，這次捕獲的個體為本種在西部海域第1筆紀錄。
中華仿對蝦
Parapenaeopsis sinica
長角仿對蝦
Parapenaeopsis hardwickii
日本鈍龍蝦
Palinustus waguensis
彎角鷹爪對蝦
Trachysalambria curvirostris
角突仿對蝦
Parapenaeopsis cornuta
鬚赤蝦
Metapenaeopsis barbata