本區因有沿岸洋流經過、多變的河口環境、平坦的沙泥海域，並位於貝類最多的印度太平洋（Indo-Pacific）海域，因此貝類共有205種以上。主要有臺灣波浪蛤、臺灣花瓣蛤、車鼓粟螺、田邊粟螺、流紋蜷、褐皮粗米螺等，而牡蠣、文蛤等，都是相當重要的經濟性食用貝類。
文蛤 Meretrix lusoria
燒酒海蜷 Batillaria zonalis