請至高鐵臺南站下車後，轉乘臺鐵沙崙線至臺南火車站，再轉乘臺灣好行99台江線至黑面琵鷺賞鳥亭站下車。
請至臺南站下車後，轉乘臺灣好行99台江線至黑面琵鷺賞鳥亭站下車（僅）。
※ 備註：賞鳥季路線：海寮紅樹林驛站、黑面琵鷺生態展示館、黑面琵鷺賞鳥亭等僅於每年10月至隔年4月例假日延駛。