野外觀察時，黑面琵鷺常會與白色羽毛的鷺科鳥類（如大、中、小白鷺等）混淆，但有幾點可作辨識。可分三個狀況來辨識：

一. 飛行：
　　大多數鷺科鳥類飛行時會把脖子縮起，而黑面琵鷺飛行時會伸長脖子，由嘴先的琵琶形狀也可與鷺科的尖形嘴區別。
 

大白鷺群	黑面琵鷺群

二. 覓食：
　　鷺科鳥類覓食時通常靠視力，成群站在深水域兩旁岸邊，淺水域則走入水中找尋魚蹤，大都以嘴尖咬住魚體再吞入，魚體大時，會以尖嘴刺穿魚體，有時見到小白鷺以腳趾拍打水體，驚擾魚隻游動再捕食。
　　黑面琵鷺通常選擇20公分水深以下的水域來覓食，覓食時會把嘴喙打開伸入水中，左右擺動有如雷達般來搜尋魚隻，先以扁平嘴夾住魚體，再把魚頭朝向喉嚨吞入。

鷺群	大白鷺	小白鷺以腳拍水
黑面琵鷺覓食姿態	咬住魚隻	吞入

　　1.黑面琵鷺與大多數鷺科休息時會聚集，常見的鷺科如小白鷺、大白鷺，其休息群體通常較為鬆散無次序，相對而言，黑面琵鷺個體間會較接近。此外，天氣寒冷時常緊密聚集，天氣熱則較鬆散。  

鷺群
黑面琵鷺群體

    
  
   
　　２. 鷺科休息的姿勢都是朝著風，縮緊脖子，頭部下垂，以兩腳站立；黑面琵鷺則如同大部分鷸鴴科水鳥，身體迎著風，把頭部轉朝後，將嘴喙放在背上，以翅膀覆蓋，先以兩腳站立，繼而縮起一腳，偶而會見到蹲坐於地上。    

鷺科休息
黑面琵鷺休息

黑面琵鷺外形辨識：
　　黑面琵鷺以體長來看，相當於中白鷺的大小，嘴喙形狀異於鷺科鳥類的楔型嘴，黑面琵鷺的嘴喙先端上下扁平闊大，前中段較窄，近嘴基再放大，形似盛飯的飯匙。

黑面琵鷺	小白鷺	大白鷺

      
                               
黑面琵鷺年齡判別：
　　黑面琵鷺族群每年九月即開始往南遷徙，有超過一半的族群會抵達臺灣度冬，其中在五、六月出生的幼鳥亦會隨著親鳥來到台江。由羽色、嘴喙、飛羽等可大致來判別其年齡。

1. 剛抵達的幼鳥羽色較灰濁，個體體型略小，相對成鳥羽色較白，體型較大。
2. 第一年的幼鳥上嘴喙呈現肉色，光滑無橫紋，初級飛羽、次級飛羽末端皆有黑塊，最外側三隻初級飛羽的前瓣更有大塊黑區，羽軸皆呈黑色。
3. 幼鳥嘴喙顏色會隨著時間變暗，由嘴喙基部開始出現橫紋往先端分布，一般而言，黑色橫紋分布到嘴喙中段應為二齡鳥，三齡以上可分布到嘴喙先段，四齡以上成鳥有時可見到嘴喙尖端呈黃色斑塊。
4. 三齡以上個體眼下會出現半月形斑塊，年齡越大黃色越大越明顯，甚至出現眼上斑。

幼鳥	幼鳥飛羽
一齡	一齡	二～三齡	四齡
一齡		一～三齡
四齡以上		成鳥全白飛羽

5. 另外黑面琵鷺成鳥眼睛的虹膜呈暗紅色，幼鳥呈暗褐色，隨年齡增長會逐漸轉成紅色。

成鳥		幼鳥

                                   
　　除了以上的辨識要點外，黑面琵鷺個體間有特殊的互相理羽行為，兩個個體間的關係究竟如何，有待觀察，在大陸遼寧形人坨的觀察紀錄中，雄鳥雌鳥間常有互相理羽行為。