台江地區有曾文溪口濕地、四草濕地等 2 處國際級濕地，以及七股鹽田濕地、鹽水溪口濕地等 2 處國家級濕地。
18 世紀時，四草濕地原為台江內海南端之北汕尾及南汕，1823（清道光 3 年）暴風雨氾濫成災，曾文溪改道，由上游沖下大量泥沙，使日漸淤積的台江內海形成一海埔新生地，同時也將台江內海分成三大鹹水潟湖，分別為鯤鯓湖（已開發為五期重劃區、安平商港及安平工業區等）、四草湖與七股潟湖。
四草濕地因泥沙淤積而形成的海埔新生地和鹹水湖，附近居民利用此地形，開發鹽田和魚塭，並種植紅樹林護衛海岸，除了已經絕跡的紅茄苳和細蕊紅樹外，其餘紅海欖、欖李、海茄苳、水筆仔都可在此看到，甚至擁有全臺最大的欖李生長區，而水筆仔是經人工復育而成的。
四草濕地範圍包含鹿耳門鷸鴴科生態保護區、北汕尾水鳥生態保護區及城西濕地特別景觀區3處。前2區為生態保護區，依據國家公園法第19條規定，進入應經國家公園管理處之許可，區內部分舊鹽田已改善為自然感潮的鹽沼濕地。豐富的紅樹林植群，是眾多生物的棲息及候鳥度冬的重要環境。