因應「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」宣布提升疫情警戒相關事項，為加強室內遊憩據點之防疫管理，台江國家公園遊客中心（臺南市安南區四草大道118號）、六孔遊客中心（臺南市七股區三鼓里海埔18號），自即日起至6月14日全面閉館。為減緩遊憩據點之人流壓力，停車場並降低停車數減量40%，本處得視現場狀況及服務品質適時彈性調整。
依據中央流行疫情指揮中心宣布，自5月15日起至6月14日，全國提升疫情警戒至第三級，停止室內5人以上、室外10人以上的聚會，並僅保留維生、秩序維持、必要性服務、醫療及公務所需外，關閉營業及公共場域。內政部營建署為減少群聚效應，預防疫情擴散，全臺各國家公園亦同步升級管制措施。
相關防疫管制措施仍視中央流行疫情指揮中心最新防疫指引，並配合各國家公園環境特性，採因地制宜方式滾動檢討。