1661年（明．永曆15年）延平郡王鄭成功拓臺聖地，供奉鄭王國姓爺座艦之「鹿耳門媽」，今已成為著名之宗教觀光聖地。清初《康熙臺灣古圖》中，鹿耳門北汕尾島上註明「媽宮」，即為明式媽祖廟之稱呼；現今臺南市安南區顯宮里媽祖宮社區，即以廟為名。
依考證，鹿耳門媽祖雕刻行制，可由明代后妃「等肩冠」、帽翅（鏤雕，可移動、拆裝）、「雲肩」、「刻金線龍袍」、「右衽」、明式龍頭寶座、朱砂入漆、持如意坐姿、菩薩法相、天妃髮髻…等證實鹿耳門媽祖為明式官方行制，材質為千年宣芝，龍袍上龍目以綠寶石鑲箝，座椅內枝外葉、八獅拱繞，一體成型雕刻而成，乃國之瑰寶，舊時有專屬之寶龕，印證於鄭王座駕拜棚，以供奉座艦媽祖。
明式官方媽祖，源於明朝永樂年間三保太監鄭和時代，錢塘媽祖廟有鄭和親筆碑文，詳細說明媽祖助其南洋立功宣揚國威。永樂帝頒令於南之龍江（鄭和故鄉），興建媽祖廟春秋致祭，為明代官方媽祖之源頭。鄭和與鄭王為宗親，郡王決心東渡台灣與鄭和下西洋同為劃時代任務，故恭請膺服南中國海之龍江官方媽祖，襄助鄭王開臺之大業。
1720年刊行的陳文達《臺灣縣志》卷之九〈寺廟條記〉：「在鹿耳門，媽祖廟康熙58年（1719年）各官捐俸同建，前殿祀媽祖，後殿祀觀音，各覆以亭，兩旁建僧舍六間僧人居之以奉香火…」。是為目前所獲最早史紀，爾後歷次修建有：1801年(嘉慶5年)總鎮愛新泰的重修；1856年(咸豐5年)，臺灣總鎮府邵連科與曾元福各官暨三郊公局等商賈捐資重興；1871年(同治10年)曾文溪改道，天后宮遭沖毀，「開基媽祖」神像暫祀民家，1946年(民國35年)再重建；1977年(民國66年)復重建，始成今貌，全名為「鹿耳門天后宮」。
（圖文資料/鹿耳門天后宮提供）