竹筏港水道因通行「竹筏」而得名，清領時期因國賽港距臺南府城頗遠，商船卸貨後，商品運送至府城尚需輾轉經鹿耳門、四草湖、安平、五條港等處。原本以鹿耳門為貿易港口的「府城三郊」，為力圖延續府城貿易與政經地位，投入大量金錢、資源經營一條人工運河「竹筏港水道」，是臺灣史上少見的人工運河工程。
國賽港及竹筏港水道都位於古台江內海範圍，受上游河道大量輸砂影響，港道淤積迅速變化無常，需時常疏濬挖通，相當不便。隨著郊商沒落、國際洋行的進入及陸運交通的改善等因素，皆使竹筏港水運重要性逐漸降低。明治44年（1911），曾文溪再度改道氾濫，造成國賽港淤塞，對於竹筏港水運運輸更造成嚴重影響。昭和5年（1930）嘉南大圳儲水庫（烏山頭水庫）興建完成，曾文溪失去上游水源，下游不能通行竹筏，日本政府遂公告廢止通行，竹筏港水運隨之走入尾聲。目前水道多為排水溝渠，部分水道更已成隱溪，難見其原有商船往來的興盛風貌。