| 101 | 保育研究科 | 經營管理 | 台江地區文史資源調查及應用規劃研究(一) | 社團法人台灣打里摺協會 吳建昇 | | 170 |
| 101 | 保育研究科 | 經營管理 | 台江國家公園歷史水域文化資產先期調查計畫 | 財團法人樹谷文化基金會 王瑜 | | 122 |
| 101 | 保育研究科 | 經營管理 | 確保黑面琵鷺食源之生態養殖計畫（101） | 國立臺南大學 王一匡 | | 83 |
| 100 | 保育研究科 | 環境監測 | 台江國家公園週邊沙洲、潟湖地景變遷及復育防災策略 | 國立台灣大學地理環境資源學系 林俊全 教授 | | 157 |
| 100 | 保育研究科 | 經營管理 | 傳統養殖漁業文化產業發展策略及確保黑面琵鷺食源之生態養殖計畫 | 國立臺南大學 王一匡 助理教授 | | 91 |
| 100 | 保育研究科 | 環境監測 | 台江國家公園及周緣地區重要生物類群分佈及海岸濕地河口生態系變遷 | 國立中興大學 林幸助 助理教授 | | 223 |
| 100 | 保育研究科 | 經營管理 | 台江國家公園及周緣地區人文歷史調查及保存規劃研究 | 社團法人臺灣打里摺文化協會 劉益昌 | | 176 |
| 100 | 解說教育科 | 經營管理 | 台江國家公園整體遊憩資源調查及規劃案 | 中華民國國家公園學會 林寶秀 助理教授 | | 149 |
| 099 | 保育研究科 | 經營管理 | 台江國家公園及周緣地區人文歷史調查及保存之先期規劃成果報告 | 中央研究院 翁佳音、劉益昌 教授 | | 225 |
| 099 | 保育研究科 | 經營管理 | 台江國家公園資源整合性系統研究發展規劃成果報告 | 國立臺灣大學 林俊全 教授 | | 124 |