本處呼應聯合國推動「國際遷移性物種公約」，101年5月16日至20日由前呂處長登元率員赴大陸與上海崇明東灘鳥類國家級自然保護區簽署合作交流備忘錄，以跨區域合作方式進行黑面琵鷺等遷移性物種的保護，建構完整遷移性物種保育網絡。
上海崇明東灘指派代表盛煜葉女士於102年8月中為期1個月交流見習，並以「崇明東灘鳥類國家級自然保護區科普工作」及「崇明東灘鳥類國家級自然保護區自然課堂建設與台江見習心得分享」主題兩場專題演講。並在與崇明東灘合作滿周年之際出版紀念專刊《點秋江白鷺沙鷗-濕地及遷移性物種跨域保育》，為共同推動保育工作之努力留下見證；103年本處亦指派兩名同仁前往交流見習、強化濕地保育及復育工作。